什么是 NGS？

下一代测序（Next-Generation Sequencing，NGS）是一种现代高通量基因测序技术，可同时分析大量 DNA 或 RNA 信息。与传统上逐个或少量基因进行分析的方法相比，NGS 可在一次检测中分析数十至数百个甚至更多基因，从而较全面地了解肿瘤细胞中的基因变异及其他分子特征。具体可分析的基因数量和变异类型取决于所使用的检测平台和检测方案。

NGS 是精准肿瘤学中的重要工具之一，可帮助医生根据肿瘤的分子特征寻找具有明确临床意义的生物标志物，并在适当情况下为治疗选择提供辅助依据。

NGS 在癌症中的应用

1. 诊断

• 可检测与部分癌症相关的基因变异，并在某些情况下辅助确认癌症类型，例如部分白血病、淋巴瘤及其他具有特征性分子异常的肿瘤。
• 可帮助区分部分在组织形态上相似、但分子特征不同的癌症亚型。

2. 治疗选择与精准医疗

• 可检测部分具有明确临床意义的可操作基因变异，为靶向治疗或部分情况下的免疫治疗选择提供辅助依据。
• 例如：
  • 肺癌中的 EGFR 变异、ALK 或 ROS1 重排：在符合相应适应证时，可用于评估是否存在使用特定靶向药物的分子依据。
  • 乳腺癌中的 HER2 扩增：可影响 HER2 靶向治疗选择。不过，HER2 状态通常还需要结合免疫组化（IHC）或原位杂交等标准方法判断，并不一定依靠 NGS 单独确定。
  • BRCA1/2 变异：在部分乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和胰腺癌等情况下，可与 PARP 抑制剂等治疗选择相关，但具体意义取决于癌种、疾病阶段及变异性质。

3. 预后与风险评估

• 部分经过验证的分子特征可提供与肿瘤生物学行为、复发风险或预后相关的信息。
• 不过，并非所有通过 NGS 发现的基因变异都能准确判断癌症是否“侵袭性强”或预测个人结局，其意义需要结合癌种、分期及其他临床因素综合解释。

4. 治疗监测与耐药机制追踪

• 癌症在治疗过程中可能出现新的分子变异，其中部分可能与药物耐药有关。
• 在适当情况下，可通过重新进行组织检测或液体活检 NGS 了解这些变化，并在存在明确证据和相应治疗选择时，为后续方案调整提供参考。

5. 遗传性癌症相关检测

• NGS 也可用于专门的胚系遗传检测，分析 BRCA1/2、Lynch 综合征相关基因等遗传性癌症风险基因。
• 需要注意的是，肿瘤组织 NGS 中发现的变异并不一定属于遗传性胚系变异。如果怀疑存在遗传风险，通常需要通过血液或其他正常组织进行专门的胚系检测，并结合遗传咨询。

 

检测过程中会发生什么？

• NGS 通常使用肿瘤组织样本进行检测，部分情况下也可使用血液样本进行液体活检。
• 实验室会从样本中提取 DNA 和 / 或 RNA，并根据检测平台进行测序及生物信息学分析。
• 结果出具时间因检测范围、样本质量及实验室流程而异，部分检测通常需要约1–3 周。
• 报告通常会列出检测到的基因变异、相关生物学意义，以及可能对应的治疗或临床试验信息。但报告中出现某种药物名称并不代表患者一定适合使用该药物。

 

主要特点与潜在价值

• 可在一次检测中同时分析多个基因及不同类型的分子异常，信息范围通常比单基因检测更广。
• 在存在具有明确临床意义的分子异常时，可为个体化医疗方案提供辅助信息。
• 部分检测结果可能帮助患者匹配符合条件的临床试验。
• 广泛基因面板有机会发现传统单基因检测未覆盖的少见分子异常，但检测范围越广也可能发现更多临床意义尚不明确的变异。

 

风险与局限

• 组织 NGS 通常需要有足够数量和质量的肿瘤细胞；样本量不足、肿瘤含量低或 DNA / RNA 降解都可能影响检测结果。
• 并非所有检测到的基因变异都有相应的获批靶向治疗或明确临床意义。
• 检测结果可能包含意义未明变异（VUS）或不同证据等级的异常，因此需要由具有相关经验的医生或分子病理专业人员进行解释。
• 部分检测可能发现偶然发现或疑似胚系遗传性变异，但肿瘤 NGS 本身通常不能直接确认遗传性癌症风险，可能需要进一步胚系检测及遗传咨询。
• 检测费用、可获得性及保险覆盖情况会因地区、癌种和检测适应证而有所不同。

 

其他相关检测

• 单基因检测（Single-Gene Testing）：针对一个或少数特定基因或变异进行检测，例如 EGFR 或 KRAS。在已有明确检测目标时，单基因检测有时可能更快速或更具针对性。
• 免疫组化（Immunohistochemistry，IHC）：用于检测组织中的特定蛋白表达，例如 HER2、PD-L1 或激素受体等，与 NGS 提供的信息侧重点不同。
• 荧光原位杂交（Fluorescence In Situ Hybridization，FISH）：可检测特定基因扩增、缺失、重排或其他染色体异常。
• 液体活检（Liquid Biopsy）：液体活检是一种样本获取和检测方式，而不是 NGS 的“血液版本”。部分液体活检会使用 NGS 分析 ctDNA，也有液体活检使用 PCR 或其他技术。

 

可以向医生询问的问题

• 为什么我的情况需要进行 NGS？哪些结果可能真正影响后续医疗方案？
• 这项检测是否属于保险覆盖范围？
• 我的情况是否适合使用液体活检，还是组织样本更合适？
• 治疗期间是否有必要重复进行 NGS？在什么情况下重新检测更有意义？
• 这项检测是否可能发现与遗传性癌症风险有关的异常？如果发现，是否需要进一步接受胚系检测和遗传咨询？

 

检测前需要了解的事项

• 建议保存完整的 NGS 检测报告，包括样本来源、检测日期、检测平台和具体基因变异，以便未来医疗团队参考。
• 可请医生说明哪些变异属于具有明确临床意义的可操作变异（actionable alterations），哪些目前主要属于信息性发现或意义未明变异。
• 如果结果提示可能存在遗传性胚系变异，可考虑进一步进行遗传咨询和确认性胚系检测；家族成员是否需要检测应根据确认结果及专业建议决定。
• 如果发现符合特定临床试验条件的分子异常，可与医疗团队进一步了解临床试验的入选标准、研究阶段及潜在风险与获益。

 

参考资料

• National Cancer Institute (NCI): Next-Generation Sequencing
• American Cancer Society: Genetic Testing for Cancer Treatment
• FDA: NGS and Oncology